แม่น้ำฮอนดูรัสส่วนใหญ่เป็นภูเขา และรายชื่อแม่น้ำที่ใหญ่ที่สุดในสาธารณรัฐกำลังเปิดอยู่ - Patuka, Ulua และ Aguan
แม่น้ำอากวน
แม่น้ำไหลผ่านดินแดนทางตอนเหนือของฮอนดูรัสโดยเริ่มจากแผนกโยโร จากนั้นเขาก็ออกเดินทางเลือกทิศตะวันออกข้ามดินแดนของกรมโคลอน และการเดินทางก็จบลงด้วยการไหลลงสู่น่านน้ำของทะเลแคริบเบียน (ใกล้ซานตาโรซาเดอากัว) ความยาวรวมของกระแสน้ำถึงเกือบสี่ร้อยกิโลเมตร Aguana มีแควหลายสาย
หุบเขาแม่น้ำถูกใช้อย่างแข็งขันในการเกษตร ในหุบเขาตอนบน/กลางของลำธารมีแปลงปลูกผักตลอดจนแปลงปลูกข้าวโพดและถั่ว หุบเขาเบื้องล่างมีข้าวและผลไม้รสเปรี้ยว ที่นี่ปลูกปาล์มน้ำมันและมะเดื่อด้วย
แม่น้ำริวสัมปุล
Rio Sumpul เดินทางผ่านดินแดนของสองรัฐพร้อมกัน - เอลซัลวาดอร์ (ส่วนทางตะวันตกเฉียงเหนือ) และฮอนดูรัส (ดินแดนทางตะวันตกเฉียงใต้) แม่น้ำสั้นมาก - เพียงเจ็ดสิบเจ็ดกิโลเมตร - และตลอดแนวความยาวแม่น้ำนี้ทำหน้าที่เป็นพรมแดนที่แบ่งอาณาเขตของรัฐเหล่านี้
แหล่งที่มาของริโอซิมปุลตั้งอยู่ในเอลซัลวาดอร์ มีแม่น้ำข้ามเขตเทศบาลหลายแห่ง (ทั้งหมดตั้งอยู่ในแผนกเดียว - Chalatenango) มันไหลลงสู่น่านน้ำของริโอ เลมปา
แม่น้ำริโอโตโรลา
Rio Torola ไหลผ่านอเมริกากลาง ไหลผ่านดินแดนเอลซัลวาดอร์ (ตะวันออกเฉียงเหนือ) และฮอนดูรัส (ตอนใต้ของสาธารณรัฐ) ระยะเวลารวมของ Rio Torola น้อยกว่าหนึ่งร้อยกิโลเมตรเล็กน้อย แม่น้ำมีต้นกำเนิดในอาณาเขตของซัลวาดอร์ ณ สถานที่ที่แม่น้ำลาฮิทัสบรรจบกับกระแสน้ำมานซูกุปากวา ปากแม่น้ำริโอโตโรลาเป็นน้ำของแม่น้ำริโอเลมปา
แม่น้ำอูลัว
เตียงแม่น้ำตัดผ่านอาณาเขตของฮอนดูรัสในตอนเหนือโดยเริ่มจากดินแดนของแผนก Intibuca (ไม่ไกลจากลาปาซซึ่งเป็นเนินเขาของเทือกเขา Cordillera de Mentesillos) ความยาวรวมของกระแสน้ำคือ 358 กิโลเมตร มีพื้นที่เก็บกักน้ำรวมเกือบสองหมื่นสามพันตารางเมตร
แม่น้ำเกิดจากการบรรจบกันของแม่น้ำ Sasagua และ Puringla ต้นน้ำเรียกว่า Rio Grande de Otoro ในขั้นต้นแม่น้ำไหลไปทางเหนือข้ามซานตาบาร์บาร่าระหว่างทาง แต่หลังจากนั้น Ulua เลี้ยวไปทางทิศตะวันตกอย่างรวดเร็วและข้ามสามแผนก - Yoro, Cortes และ Atlantis - เสร็จสิ้นเส้นทางในน่านน้ำอ่าวฮอนดูรัส
แม่น้ำโกสโครัน
Goaskoran ส่องเส้นทางผ่านดินแดนฮอนดูรัสและเอลซัลวาดอร์ ข้ามประเทศทางตอนใต้ ความยาวของกระแสน้ำประมาณหนึ่งร้อยสามสิบกิโลเมตรโดยมีพื้นที่เก็บกักน้ำสองพันหกร้อยหกสิบสามตารางกิโลเมตร
สิบแปดกิโลเมตรสุดท้ายของกระแสน้ำเป็นพรมแดนธรรมชาติระหว่างสองรัฐ น้ำ Goaskoran เป็นแหล่งน้ำดื่มสำหรับผู้อยู่อาศัยในประเทศที่อาศัยอยู่บนชายฝั่ง